生物修复也称为生物消毒，生物再生或生物恢复，是利用生物特别是微生物催化降解环境中的某种或某几种有机污染物，从而消除环境污染的一个受控或自发进行的过程。而在水产养殖系统中，由于忽视资源与环境的协调发展，养殖环境质量每况愈下，特别是在海水养殖的现行养殖模式下，海水养业的生态环境主要是有机物污染，这些污染物主要来自于残饵、粪便等。由于这些有机污染物不能被及时分解转化，而逐年积累，导致养殖池的生态环境严重恶化，濒临崩溃，这也是造成养殖动物病害发生的主要原因之一。

    以我国的主要养殖区为例，约有50%的池塘受到较严重的污染，30%的池塘受到中度污染，有20%的池塘受到轻度污染。应用生物修复技术保证水产养殖资源的可持续利用和产业可持续发展是目前海洋生物技术研究发展的一个重要领域，其中海洋生物修复技术的开发与应用是环境生态技术研究发展的重点。生物修复技术作为一项高效、节能的环保技术，已被国外广泛用于治理水域环境。而随着海水养殖业的污染问题的日益突出，人们极力探索改善养殖环境，净化养殖水质的方法与途径。

    科技人员在利用现代生物技术，从自然环境中分离得到对生态环境中有机物具有降解作用的微生物，如能降解养殖水体中氨态氮或亚硝基态氮的硝化细菌、能对养殖环境致病性细菌有裂解作用的噬菌蛭弧菌，通过生物工程技术对所分离的微生物进行选化、筛选，得到了能有效改善养殖水体环境的微生态制剂，为更好地发展海水养殖业提供了基础。