根据协议，联合基金总额为每年3000万元，由国家自然科学基金委员会与云南省政府在协议期内每年分别出资1500万元。联合基金将根据云南省经济与社会发展的需求，结合国家战略发展布局，重点选择以生物多样性保护、矿产资源综合利用与新材料、资源与环境、人口与健康等领域，吸引和聚集全国范围的科学家，与云南的科技人员相结合，开展基础研究。

　　协议规定，联合基金是国家自然科学基金的组成部分，双方设立联合基金管理委员会，负责联合基金资助领域、项目指南、资助计划及其他重大事项的决策。出席签字仪式的国家自然科学基金委员会主任陈宜瑜在致辞中说，联合基金是发挥科学基金导向作用的重要形式，利用自然科学基金平台，按照科学基金制的运作方式，面向全国，自由申请，引导全国科学家围绕特定领域的科学前沿和国家、区域发展战略需求，从国家层面上凝练科学问题，遴选和支持优秀的学术思想和项目，资助科学家进行自由探索和创新研究。