1. 在农业生产中的应用

    西方国家在上个世纪30年代实现了农业生产的机械化、化学化后，使农业劳动生产率，农畜产品的产量大幅度提高，但是随着时间的推移，进入60年代以来，这种生产方法却带来了许多不可避免的负面影响及累积效应。卡尔逊在其所著的《寂静的春天》一书中对杀虫剂对环境与生物的破坏与影响做了深刻的分析。种植与饲养的动植物品种单一化加重了病虫害和杂草的发生与蔓延，大量化学物质的投入造成土壤、水体和农产品的严重污染，这些问题不但影响到农业生产的进一步发展，而且还威胁到农产品持续供应的可能性，为此西方发达国家提出了各种形式的替代农业类型，运用一些生态学原理与生态工程技术手段来提高资源的利用率与保护生态环境。

    我国在农业生态工程的研究与进展取得了令人注目的成绩，特别是我国生态农业建设层次，无论是从农户到村庄、从乡镇到县城，把生态农业技术与工程技术结合创造了具有自已特色的农业生态工程，十分注重生态与经济效益的结合，把农业生产与生态环境的建设保护结合起来，同步发展。1994年我国政府制定、颁布了中国21世纪议程，明确指出要推进农业可持续发展的方式，就是生态农业建设。1999年国务院印发“全国生态环境建设规划”，要用50年的时间基本上实现中原大地山川秀美，要继续抓好生态农业建设，建设好一批农业生态工程。1993年起动的全国的生态农业试点县，经过5年的建设，生态环境得到了较大的改善。土壤沙漠化的治理率为60.5%，水土流失治理率为73.4%，森林覆盖率为30.5%，提高了3.7%，废气净化率为73.4%，废水处理率为57.0%，固定废弃物利用率为31.9%，比实施农业生态工程前有较大幅度的提高。

2. 在环境保护中的应用

    生态工程在环境保护中的研究与应用较为广泛。特别是体现了污染物的处理与利用，污染水处理与湖泊、海湾的富营养化防治更为突出。如在美国的俄亥俄州中，应用蒲草为主的湿地生态系统处理煤矿所排含有FeS酸性废水的生态工程。在瑞典也建立了若干污水处理生态工程，利用污水作为肥料，农田灌溉处理净化污水。在德国、荷兰、奥地利等国结合生态技术建立了各种各样的污水处理与净化工程。

    我国长期以来已在废物利用、再生、循环等方面积累了许多的经验。如生活污水及粪便的多级处理，用作农田肥料或养殖蚯蚓，培植食用菌。如马世骏等运用生态学的理论与生态工程，在50年代首先提出调控湿地生态系统的结构与功能来防治蝗虫灾害。在我国，环保生态工程的建设就是从整体出发，研究和处理特定生态系统的内部结构与功能，并加以优化与提高生态系统的自净能力与环境容量，从目前我国环境生态工程建设的内容及环保生态工程的5种类型：①无废（或少废）工艺系统，主要用于内环境治理；②分层多级利用废料生态工程，使生态系统中的每一级生产中的废物变为另一级生产过程的原料，使废料均被充分利用；③复合生态系统内的废物循环，再生系统，如桑基鱼塘生态工程；④污水自净与利用生态系统；⑤城乡（或工、农、牧、渔、副）结合生态工程来看，都是在一定区域内，应用生态工程理论与技术来分层、多级利用废料实现生态、经济效益的良好协调统一。