全基因组作图反映发育及环境影响

　　美国加利福尼亚大学戴维斯分校（UC Davis）的研究人员指出，帮助植物适应环境挑战的复杂品质可能受数千个基因的变异影响，而基因又受到植物生长与外界环境的影响。

　　他们的发现是通过对拟南芥（Arabidopsis thaliana）这种常见的研究植物的防御新陈代谢的全基因组关联作图得到的。这项由UC Davis植物科学家Daniel Kliebenstein领导的研究发表在8月16日的《科学公共图书馆--遗传学》的网络版上。

　　研究中，Kliebenstein与同事对芥子油苷（GSL，植物为防御昆虫袭击及致病生物体而产生的一类关键化合物）进行了测定。研究人员在植物发育的两个不同阶段对芥子油苷进行了测定：发芽后2天和35天。他们还对植物组织采用或不采用硝酸银处理来模拟由害虫引起的环境伤害，然后对植物组织进行采样分析。

　　“结果表明外界及内部环境对已识别基因的改变如此之大以至于使用来自不同发育阶段或被硝酸银处理过的植物组织导致就特定品质而识别的基因集差异很大，”Kliebenstein说。

　　小组指出植物发育阶段对他们所识别的基因的影响是环境影响的3倍。

　　因为全基因组关联作图识别到如此多可能与GSL新陈代谢相关品质关联的不同基因，研究人员开发了一种新的程序来筛选候选基因。这个过程通过分析交叉的基因组信息数据集来过滤出真正阳性的基因识别。

　　全基因组关联作图就是在整个基因组内快速扫描标记来寻找与某种品质、环境或病害相关的基因变异。这种方法已经被用来研究哮喘和糖尿病等复杂的人类疾病。

　　研究人员希望这种新的全基因组关联双叉途径可以用于任何植物与动物物种。

　　研究受美国国家科学基金会资助。（babymouselover编译/环境生态网）